有没有可能比Remdesivir更有效的药

写在前面：9天前我还只是一个医学的小白，我写点冠状病毒方面的知识，不是为了买医药股票，也不是为了囤药卖，有人如果要治疗的建议，我也只能发给你别人的我觉得靠谱的，本人不涉及中药粉黑、本人不涉及政治对错、本人只是为了科学，我想了解了解冠状病毒，仅此而已

知识，是战胜愚昧的最重要的武器

今天内容有点硬核，我有点难以理解，所以有些难产

先来读网上的这篇文章：Remdesivir的相关总结

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原文我不想搬了，没意思，大致说明了Remdesivir一些科普

我来谈谈那几篇引用的论文，原文就是按论文来写的，具体读论文，可以发现许多有意思的东西

常用的抗CoV治疗小分子药物的酶靶点包括组织冠状病毒3C类蛋白酶、木瓜蛋白酶、 非结构蛋白12（nsp12）、RNA依赖RNA 聚合酶（RdRp）等。Remdesivir（GS-5734）属于抑制RNA 聚合酶（RdRp）

论文1：Mechanism of Inhibition of Ebola Virus RNA-Dependent RNA Polymerase by Remdesivir

Remdesivir抑制埃博拉病毒RNA依赖RNA聚合酶的机制

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论文介绍了这个药对于埃博拉病毒（EBOV）和呼吸同步病毒（RSV）的作用机制。Remdesivir在体内以三磷酸化（Remdesivir-TP）成为活化形式，和ATP竞争参与病毒RNA的转录。Remdesivir-TP的插入可以提前终止RNA的转录过程，而抑制病毒的扩增。

Remdesivir （GS-5734） 是一种 1-氰化物替代腺苷核苷模拟药物，显示针对多种RNA病毒的广谱抗病毒活性。该化合物目前正在临床开发中，用于治疗埃博拉病毒病（EVD）。虽然在细胞培养和非人类灵长类动物中已经证明了抗病毒作用，但埃博拉病毒（EBOV）抑制Remdesivir的作用机制仍有待充分阐明。EBOV RNA依赖RNA聚合酶（RdRp）复合物最近被表达和纯化，使生物化学研究与相关的三磷酸（TP）形式的remdesivir及其推定目标。在这项研究中，我们确认Remdesivir-TP能够与三磷酸腺苷（ATP）竞争合并。酶动力学显示EBOV RdRp和呼吸道合胞病毒（RSV）RdRp结合ATP和remdesivir-TP具有类似的效率。ATP 对 remdesivir-TP 的选择性为 EBOV RdRp 的 ~4倍和 RSV RdRp 的 ~3倍。相比之下，纯化的人体线粒体RNA聚合酶（h-mtRNAP）有效地区分了具有~500倍选择性的remdesivir-TP。对于EBOV RdRp，位置i内合并抑制剂不影响随后在位置i+1处的核苷酸结合事件。对于RSV RdRp，我们在位置i+1处测量了~6倍的抑制，尽管RNA合成没有终止。在这两种情况下，链端接都延迟了，主要出现在i+5位置。此模式特定于 remdesivir-TP 及其 1 -氰化物修饰。在2位置进行修饰的化合物表现出不同的抑制模式。虽然未合并 2 -C-甲基-ATP，但 ara-ATP 充当非约束链终止器，并防止在位置 i+1 处纳入核苷酸。综合起来，我们的生化数据表明，remdesivir对EBOV RNA合成抑制的主要贡献可归因于延迟链终止。内联核苷酸模拟体与其抑制作用之间的五个残留物的长距离值得进一步研究。

图1 左侧为Remdesivir（前药），右侧为Remdesivir-TP（活性成分）

另外的几种药分别是：Favipiravir法匹拉韦、Ribavirin利巴韦林、吉利德BCX-4430

预防和治疗RNA病毒的感染仍然具有挑战性。2014年西非埃博拉病毒病（EVD）疫情造成约28，000例病例和11，310例死亡，并清醒地提醒人们医疗需求未得到满足。在疫情期间进行的密集研究导致发现和开发几种疫苗和药物候选药物。EBOV有前途的实验性疫苗是以包络糖蛋白作为抗原靶点为基础的。单克隆抗体和核苷酸模拟抑制剂代表研究性疗法。ZMapp是三种单克隆抗体的鸡尾酒，靶向EBOV糖蛋白，在非人类灵长类动物中逆转EVD。然而，随机临床试验的结果没有结论。与基于糖蛋白的疫苗一样，抗体鸡尾酒也对所有埃博拉病毒物种也无效。相比之下，几种核苷酸类似物显示针对不同埃博拉病毒物种和其他负感和正感RNA病毒的抗病毒活性。

法匹拉韦Favipiravir（T-705）是一种核苷前体，已获准在日本治疗大流行性流感。细胞内磷酸化产生三磷酸酯形式（T-705-RTP），由病毒RNA依赖RNA聚合酶（RdRp）（图1）。重组流感RdRp的实验显示，与西丁丁和尿氨酸的碱基配对不明确，这可能导致致命的诱变。将T-705-RTP纳入生长的RNA链也会导致RNA合成的适度抑制。法维皮拉韦在体外对大量RNA病毒（包括EBOV）具有活性。临床评估一直具有挑战性，多中心非随机试验的结果基本上没有结论。基础功能结构和拟议的作用机制让人联想到利巴韦林Ribavirin，它用于治疗丙型肝炎病毒（HCV）感染已有十多年（图1）。一种结构上截然不同的广谱抗病毒药物，在体外也对EBOV有效，是吉利德（BCX4430）。BCX4430是一种腺苷类化合物，含有氮替代糖环，同样需要细胞内激活到TP形式（图1）。生物化学实验表明，该化合物作为丙肝病毒RdRp的基质，在合并后引起链端接。

Remdesivir （GS-5734） 是一种磷酸原药，用于 1-氰化物代用腺苷模拟，在亚微微菌范围内以半最大有效浓度 （EC50） 抑制埃博拉病毒，该值大大低于报告的值用于法匹拉韦或吉利德（BCX4430）。雷德西韦（remdesivir-TP）的三磷酸盐形式被证明能抑制EBOV RdRp的RSV RdRp代理。而人体RNA Pol II和人线粒体RNA聚合酶（h-mtRNAP）没有明显抑制作用。使用纯化重组RSV RdRp获得的生化数据以及最近用NiV RdRp进行的一项研究指出，延迟链终止是一种可能的行动机制。延迟链终止是指抑制RNA合成中下游的一些残留物的合并抑制剂。然而，抑制结果尚未在数量术语和数据与重组EBOV RdRp缺乏。RSV、NiV 和 EBOV 是非分段病毒，对RNA合成有相似的要求。RSV 和 NiV 的 RdRp 活性需要多功能 L 蛋白和磷蛋白或 P 蛋白。虽然L蛋白含有聚合酶活性位点，但P蛋白是形成活性复合物所必需的。我们最近表示活性EBOV RdRp含有与病毒蛋白35（VP35）复合的L蛋白，这是P蛋白的功能等效。在这项研究中，我们利用EBOV RdRp复合物研究了雷德西韦的作用机制。我们证明，在位置i中加入核苷酸模拟会导致延迟链端接，主要在位置i+5。

人才。。。。

读到这里，我有个疑问啊，既然三磷酸盐形式被证明能抑制病毒的RdRp代理，那么如果Favipiravir法匹拉韦、Ribavirin利巴韦林加了三磷酸盐形式后，会变得怎么样呢？谁有空去实践一下

下面的论文，就是具体的实验方法：

我解释一下，ATP就是三磷酸腺苷，就是分子式中磷酸化的那部分，Remdesivir-TP就是Remdesivir去掉ATP的那部分，ATP与Remdesivir-TP两者加起来，就是Remdesivir

位置4-11，都是病毒RNA 聚合酶（RdRp）的具体基因位置

注意最后那个表格，我们人类肉眼可以从分子式中分辨出ATP与Remdesivir-TP的不同，但是埃博拉病毒聚合酶（EBOV RdRp）和呼吸道合胞病毒聚合酶（RSV RdRp）居然傻傻得分辨不出来

尴尬的是，人体线粒体RNA聚合酶（h-mtRNAP）居然能分辨得出来

这是具体的分辨率，EBOV是3.8倍、RSV是2.7倍，h-mtRNAP居然高达508倍

读到这里，我有个疑问，既然ATP（三磷酸腺苷）被证明有效，那么Favipiravir法匹拉韦、Ribavirin利巴韦林加了三磷酸盐形式后会怎么样呢

更进一步，我们都知道，在体外活性实验中，Chloroquine氯喹比Favipiravir法匹拉韦、Ribavirin利巴韦林都更优秀，那么Chloroquine氯喹加了三磷酸盐形式后会怎么样呢

留给他人去证实吧

在论文里，研究人员还隐晦得提出了一些忧虑：

通俗得说，RNA复制的转录仅发生在 i+1 到 i+5 之间，也就是下图的位置4到7之间，在 i+1 到 i+5 之间加入抑制剂不能有效得抑制RNA复制

这样有效的位置仅有位置5和6

这样自然衍生出一个问题：如果病毒进化了怎么办

事实上，我们事后都知道，Remdesivir在对抗埃博拉病毒的效果并不理想

实验人员还做过一些努力，比如改变抑制剂的浓度、再改变抑制剂作用的位置，貌似不能有效改变RNA转录的位置，位置依旧在 i+1 到 i+5 之间。凉拌

再比如，继续做努力，改变基液的浓度，再将抑制剂直接作用于 i+6 的位置，貌似没用。依旧凉拌

文末，作者总结时还提到

Remdesivir相关的广泛抗病毒活性属性，提出了延迟链终止是否是抑制的统一机制的问题。

总之，这项研究提供了证据，证明延迟链终止是可行的。在对抗乙肝(HBV)病毒和艾滋病(HIV-1)病毒的过程中。一个突出的例子是恩特卡韦，一种已批准用于治疗乙肝病毒感染，Seifer和他的同事报道HBV聚合酶在I+2和I+3位置受到抑制。而我们先前研究的HIV-1 RT，一位少校抑制的贡献者是I+3位置的延迟链终止。脚印实验所提供的证据显示，该酶的位置不足以支持下一个核苷酸。然而，这种酶重新定位的结构原因难以捉摸。雷莫司韦的抑制作用更远，这表明延迟链终止，可能是由不同的机制引起的。

这样说起来，新冠病毒的延迟链终止（就是抑制转录）的位置也是i+5，这次真幸运

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