高通量强算力 | 贝瑞基因引入下一代革命性长读长测序系统Revio

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近日,第三代测序仪研发和制造企业 Pacific Biosciences(PacBio)推出新品 Revio长读长测序系统,实现了更高的HiFi 数据通量、更强的计算能力。作为PacBio全球主要的合作伙伴,贝瑞基因也是此次Revio全球发布的官方合作商,将引入并使用该测序仪。

随着硬件不断提升,公司也将积极推进三代测序技术的临床应用与科学研究,落地硬核产品,守护大众健康。

如果用一组数据来展现Revio的性能,超级芯片、超高通量、成本可及的革命性突破便一览无余。

Revio能够提供每年以30倍覆盖率对多达1300个人类全基因组进行测序的能力,每个测序成本不到1000美元,将基于HiFi的人类全基因组测序推进至1000美元时代

Revio 采用了全新的 SMRT Cell 芯片,其密度是现有(8M)的三倍,上面有2500万个ZMW(零模波导孔)。Revio 能同时并行多达4个 SMRT Cell,总共可同时提供多达1亿个 ZMW(零模波导孔)进行单分子实时测序。结合计算方面的重大进步,Revio 将提供更短的运行时间,并将 HiFi 数据通量增加15倍。准确的原始长读长、均匀的测序覆盖、变异检测准确率和组装完整性,以及准确的 DNA 甲基化检测,这一切都在更大的通量规模上实现。

                                                     图源:PacBio官网

此外,Revio 采用了先进的 NVIDIA GPU 系统,与 Sequel IIe 相比,计算能力提高了20倍同时耗材的使用量减少了一半,并在工作流程和便利性方面进行了重大改进。值得一提的是,Revio还将与Google Health 开发的深度学习方法集成到测序仪中,以此提高 HiFi 的产量和测序准确性。 

PacBio表示,Revio 能够让 HiFi 测序应用于人类遗传学、癌症研究、农业基因组学等方面的大型研究。

2019年,贝瑞基因与PacBio达成长期合作。双方联合开发的三代测序平台 Sequel® II CNDx  目前已进入医疗器械注册临床试验阶段。该平台基于单分子实时测序技术,能够提供高精度、超长读长、均匀覆盖以及直接检测碱基修饰的技术能力。作为二代高通量测序平台的有效补充,可以检测某些复杂单基因重大疾病。

今年1月,双方开始联合开发基于第三代测序技术的桌面测序仪,这款测序仪小巧便捷,可灵活部署,降低了使用门槛,具有极高的性价比。此次联合研发将满足多层次的需求,把服务中国临床推进到更深入的阶段。

目前,贝瑞基因 Sequel II/IIe 测序仪已达21台,在此基础上,公司为广大基因组学和转录组学研究者提供优质的测序服务,目前已完成3500+三代测序项目,累计完成万余例样本。PacBio测序下机Cell数已超8000个,PacBio HiFi data单个Cell产出突破45G

                                 贝瑞基因PacBio Sequel II/II e测序中心

基于性能优异的三代测序仪,贝瑞基因在临床科研的指引下,持续拓展三代测序应用场景,落地了三代地中海贫血、三代CAH(先天性肾上腺皮质增生症)、三代SMA(脊髓性肌萎缩症)、三代FXS(脆性X综合征)产品。

未来,随着Revio平台的引进和使用,贝瑞基因将持续打磨三代测序产品服务,向更多复杂基因变异疾病发起挑战,由点及面、从一到多,力求在单基因全病种的检测上做到“一键解决”!