病毒载体的主要问题是感染率有限（现在已有病毒最高能做到90%+）；插入位点无法控制；有潜在致癌风险；而且携带的碱基数量有限，无法插入很多的外源基因。局限太多。我相信未来基因工程的多数操作将由微生物完成，因为它们低耗而高效。