我国的兽用疫苗研制实行行政审批制，疫苗从研发到上市，主要经历实验室试验、临床试验（1年至1年半）、新兽药注册（最多330个工作日）、批准文号审批（2个月内）、疫苗生产、疫苗推广应用等若干阶段。
除了一般流程外，兽用疫苗等兽药研发还有一些“绿色通道”。对于重大动物疾病应急处置所需的兽药，农业农村部可以采用应急评价。应急评价申请通常指，在完成了部分临床试验（且数据较为不错）的情况下，针对特殊情况可跳过新药注册阶段（用时大约1年），直接核发批准文号并上市，相当于缩短了流程时间。