智飞生物2021前三季度营业收入218.29亿元，同比增长97.55%，相较于19年增长184.74%（19-21前三季度复合增速68.74%）；归母净利润84.04亿元，同比增长239.05%，相较于19年增长376.68%（19-21前三季度复合增速118.33%）；扣非净利润84.18亿元，同比增长239.06%，相较于19年增长368.27%（19-21前三季度复合增速116.40%）。
其中，单Q3营业收入86.57亿元，同比增长113.44%，环比增长-6.36%，相较于19年增长229.48%（19-21第三季度复合增速81.52%）；归母净利润29.13亿元，同比增长199.06%，环比增长-36.01%，相较于19年增长372.91%（19-21第三季度复合增速117.46%）；扣非净利润29.15亿元，同比增长200.59%，环比增长-36.07%，相较于19年增长369.41%（19-21第三季度复合增速116.66%）。三季报业绩符合市场预期。
业绩符合市场预期，新冠疫苗持续放量，常规疫苗恢复增长。Q3新冠利润约15亿元，销量约在1-1.2亿剂，前三季度合计销售约2.2-2.5亿支，累计贡献利润约50亿元；常规疫苗贡献利润约14亿（同比增长44%），其中HPV疫苗约贡献10亿利润，销售约500万支，前三季度合计销售约1000万支。
盈利能力和整体运营效率有所提升。报告期内公司整体毛利率为54.01%，同比增长13.99个pp；净利率38.50%，同比增加16.07个pp，主要是新冠业务带来盈利能力大幅提升。销售费用率5.61%，同比下降1.80个pp；管理费用率 0.92%，同比下降0.36个pp；财务费用率0.09%，同比下降0.91个pp。研发投入达到9.47亿元（+159.15%），主要是新冠疫苗等项目资本化投入增加所致。
其他重要财务指标，前三季度经营活动净现金流为83.21亿元，同比增长237.17%，收现比0.86，净现比为0.99，净利润有现金支撑。
存货67.18亿元，同比增长97.26%，环比增长38.86%，主要是按计划采购代理产品增加所致，为Q4代理产品销售提供保障。
在建工程16.98亿元，同比增长87.33%，环比增长31.73%，主要是新型联合疫苗产业化项目、生物制药产业园（A）区项目建设投入增加所致。
新冠疫苗前三季度为公司贡献约50亿利润，国内接种窗口期基本结束，新冠贡献未来主要看出口，公司正在加紧准备国内上市及WHO预认证，出口销量具有不确定性。
上半年HPV疫苗批签发量略减少，Q3已经恢复批签发，独家代理默沙东疫苗国内需求旺盛，成长稳定，短期内依然是公司收入和利润的主要来源。明年自主业务主要看宜卡+微卡放量，未来3-5年三代狂犬、四价流感疫苗、冻干三联苗、四价流脑结合、15价肺炎、23价肺炎等产品上市放量。
公司在今年以来新冠疫苗对常规疫苗接种的冲击中展现出极强的韧性，做到了既稳定生产新冠疫苗，又能保障常规疫苗的生产和销售，没有拖累常规疫苗的业绩目标，在同行公司中表现优秀。