轮回二元育种体系是牧原股份在生猪养殖领域的一项核心技术，它代表了公司在育种技术上的创新和突破。这种育种体系的核心在于利用两个不同的猪品种进行杂交，产生商品代肉猪，而这些商品代肉猪中的母猪又可以被选留为能繁母猪，继续参与下一轮的繁殖过程。
与传统的三元杂交体系相比，轮回二元体系的优势在于它能够缩短繁殖周期，提高扩产的灵活性。在传统的三元杂交体系中，商品代肉猪不能直接作为种猪使用，而必须通过额外的育种步骤来选育新的种猪。相比之下，轮回二元体系允许商品代肉猪中的母猪直接留作种猪，这样就大大减少了育种所需的时间，加快了繁殖的速度。
此外，由于轮回二元体系实现了“肉种兼用”，即商品代肉猪中的母猪可以成为能繁母猪，这使得牧原股份在扩大养殖规模时具有更高的效率和灵活性。这种体系类似于制造业中的一种理想情况，即一家公司生产的产品同时也是生产该产品所需的机器，从而理论上可以实现像细菌繁殖那样的指数级增长。
目前，国内只有牧原股份掌握了这项二元轮回育种技术，这使得公司在养殖规模的扩张上具有明显的竞争优势。该体系的形成并非一蹴而就，而是牧原股份在长达30年的养猪历程中不断创新的结果。起初，这种育种体系是出于成本控制的考虑而建立的，但随着时间的推移，它展现出了强大的留种能力，并在非洲猪瘟疫情后的规模扩张中发挥了巨大的作用。