碳排放权交易对垃圾焚烧发电的盈利贡献也值得关注。
在垃圾焚烧项目全生命周期补贴时间内（约15年），碳交易相当于是“第三业务”，可贡献除售电和垃圾处置费之外的业绩来源。
随着国补到期，绿证交易补贴机制和碳交易机制可二选一，此时碳交易可替代部分国补。
长江证券测算，垃圾焚烧度电碳净减排量约2.32kg，CCER单价分别取10-30 元/吨、国补电价按照 0.15 元/kwh 计算时，度电碳出售收益可替代国补比例约为15%-46%。
即：对于垃圾焚烧项目来说，参与 CCER 交易的优势在于运营期前 15 年获取增量收益，而在运营期后 15 年部分弥补国补电价取消带来的损失。
从项目整体 IRR 来看，以均价 20 元/吨参与 CCER 交易后上述垃圾焚烧测算模型的权益 IRR 为 11.7%，高于国补新政出台前的 10.7%的水平。