一、支付宝账户设置
支付宝在每一家商业银行都开立对应的存款结算户，客户的支付宝账户是一种虚拟账户。支付宝因为各种原因（和银行合作关系的维护、分散资金过于集中的风险等等），会在各家银行都开立账户并存有一定量的“备付金”，以备用户提现之用。举例来说，当招行用户申请提现的时候，支付宝就从支付宝在招行的结算账户中将资金转入到用户存款账户中，这个过程属于同行交易，是可以做到实时且免手续费的，在成本和用户体验两方面都很划算。支付宝会对不同银行间的结算账户进行动态的资金调拨，以保证流动性的需要。例如，支付宝可以进行跨行资金调拨，把工商银行结算账户里的资金转移到招商银行结算账户去，这笔转账需要经过央行大小额支付系统，且在央行日终轧差，可能无法实时到账，会产生一点点手续费，并略微影响用户体验。
二、支付宝系统的定位及与其他系统的关系
支付宝作为第三方支付，为买方、卖方提供资金的清算与结算。与支付宝系统存在信息和资金关联的系统主要有三类：1）电商平台系统，例如淘宝、亚马逊、我买网、糯米网等，用户在电商系统生成订单，电商系统并将用户付款请求发送给支付宝；2）商业银行清算系统，主要处理买方、卖方以及支付宝开立在各商业银行的结算账户的清算与结算；3）人民银行网上支付跨行清算系统（简称网银中心）、人民银行清算账户系统（央行清算账户系统）。网银中心用于处理第三方系统发起的第三方贷记业务。支付宝公司在人民银行开立有清算账户。
三、支付宝系统支付处理模式及账务处理
我们都知道支付宝的付款方式包括很多种，包括支付宝余额、银行网银、快捷支付、国际银行卡、信用卡分期、货到付款、网点付款、支付宝卡、消费卡等。本文重点针对支付宝余额支付以及银行卡支付这两种主流的支付方式进行举例说明，对于其他支付方式支付宝处理起来相对比较简单，本文不再详细描述。
模式一：银行卡付款
该模式包括的付款方式包括网银、快捷支付、国际银行卡、信用卡分期等，主要特点是支付处理路径通过央行网银中心，买卖方清算银行实时轧差，买卖方银行账户实时清算。顺便提句，普通的网银付款方式需要对买家进行在线认证。快捷支付基于协议认证，用户授权支付宝进行支付。一个典型的操作流程参照下图所示：
上图体现的主要是支付流程中的信息流，接下来让我们看看资金流如何在不同账户中流动。为了体现资金流的动向，笔者采取会计记账的方式来表达，具体的账务处理过程如下：
付款清算行完成认证处理后的账务操作
会计主体：付款清算行
会计分录
借：××存款—买家账户
贷：待清算支付款项
付款清算行收到“已清算”通知后的账务操作
会计主体：付款清算行
会计分录
借：待清算支付款项
贷：存放中央银行款项
收款清算行收到“已轧差”通知后的账务操作
会计主体：收款清算行
会计分录
借：待清算支付款项
贷：××存款—卖家账户
收款清算行收到“已清算”通知后的账务操作
会计主体：收款清算行
会计分录
借：存放中央银行款项
贷：待清算支付款项
模式二：支付宝余额付款
支付宝余额付款相比下要简单很多，主要特点是支付处理路径在支付宝系统内完成，只有当买家确认卖家发货后，才会真正支付货款。详细例子参照下图所示：
同样，让我们看看资金流是如何流动的：
买家从银行账户转账到支付宝账户的账务操作
会计主体：买家XX账户行
会计分录
借：××存款—买家账户
贷：支付宝XX行存款结算账户
会计主体：支付宝
会计分录
借：支付宝XX行存款结算账户
贷：买家支付宝账户
买家支付宝账户扣款的账务操作
会计主体：支付宝
会计分录
借：买家支付宝账户
贷：待清算支付账户
支付宝将交易款项支付给卖家支付宝账户
会计主体：支付宝
会计分录
借：待清算支付账户
贷：卖家支付宝账户
卖家从支付宝账户转账到银行账户的账务操作
会计主体：支付宝
会计分录
借：卖家支付宝账户
贷：支付宝XX行存款结算账户
会计主体：卖家XX账户行
会计分录
借：支付宝XX行存款结算账户
贷：××存款—卖家存款账户
看完这些会计分录是不是很晕，其实只要充分理解支付宝的账户设置，理解起来并不困难。
基于对支付宝账户体系的理解，有很多衍生问题都不难回答，下面挑几个试试。
四、支付宝的盈利来源
1）支付服务佣金收入，收费对象主要是电商平台（淘宝也要付费给支付宝的），其次是付款方清算银行（网银中心规定的第三方代收费用）。
2）利息收入，支付宝在商业银行的存款结算账户可以获取利息收入。
3）广告分润及增值服务，支付宝为促销商家、网站（例如海淘、一淘比价）、应用商店导入流量等。
五、支付宝的三级风险管控
level 1：支付宝系统风控措施，包括安全存储、安全传输、可疑交易监控、流动性管理等。
level 2：阿里集团对支付宝的风控措施，由阿里旗下的法务、反洗钱中心、资金监管中心等专职部门承担。
level 3：人民银行等监管部门进行定期抽查、政策指导与数据报送。
其实围绕支付宝还有很多焦点问题值得探讨，例如支付宝是如何进行对账的，支付宝如何进行反欺诈风险识别与处理等等，这些问题已不在我的能力圈范围内了，欢迎网友补充！
以上心得来自：知乎、央行现代化支付系统管理办法