造成安宫牛黄丸价格差异的原因有很多，其中最重要的是原药质量不同。比如天然牛黄、天然麝香，是需要经过国家特批，才可以使用的，并不是所有的药厂，都可以使用天然牛黄、天然麝香来入药的。
再加上天然牛黄货源不稳定，有的需要进口，甚至从国外进口，都无法满足需求量，导致天然牛黄的价格，比黄金的价格还要高。牛黄具有清热解毒、镇静豁痰、息风止痉的作用。
天然牛黄是牛胆囊的胆结石，人工牛黄是从猪胆汁中提取的药物秘制而成，两者之间是有本质区别的，疗效、价格也相差很多。麝香也一样，人工麝香的价格，相对比较低一点，这就是造成安宫牛黄丸的价格差距的重要的原因。
再加上生产工艺制作上的不同，有些厂家，比如北京同仁堂，采用传统工艺与现代工艺，相结合的方式生产，生产严谨、工序有一百多道，严谨的工艺使药物可以更好地发挥药效，但也导致了人工成本的增加，例如北京同仁堂水飞法去雄黄和朱砂重金属工艺。
北京同仁堂的安宫牛黄丸，采用天然牛黄、天然麝香的同时，还在药丸的外面包裹了一层金箔，要是想把黄金制成金箔，不仅需要较高纯度的黄金，还需要千万次的锤炼，才能使黄金变成薄如蝉翼的金箔，这时的黄金，才可以作为食用药用的原料。而有些安宫牛黄丸，是不包金箔的，因此也是造成安宫牛黄丸，价格有一定的差异。
目前只有北京同仁堂安宫牛黄丸是国家保密配方和国家级非物质文化遗产工艺，也是第一家获批使用天然麝香入药的企业。其他厂家安宫牛黄丸皆是按国家药典配方生产，例如白云山，南京同仁堂，广誉远，胡庆余堂，九芝堂，宏济堂，片仔癀等。这也是北京同仁堂安宫牛黄丸价格高的一部分原因。
下面我们通过漫画形式讲解为什么安宫牛黄丸价格相差几百元的原因：
