伤寒也叫卒病，以急性烈性传染病为主，如伤寒、霍乱、出血热等，范畴较广；温病则主要是呼吸系统感染疾病。
伤寒六经的六个层次：太阳病-外周神经及局部微循环障碍，风湿病、痉病皆其类也（桂枝促进体表血液循环、麻黄宣肺开腠理发汗、葛根缓解周围神经肌肉紧张）；少阳病-表里不合即内部分泌失调，故病似女子来大姨妈（柴胡扶助任脉，促进下丘脑的功能）；阳明病-阳明血海，故病血液热症（石膏增加血钙以抑制血液循环亢进；三黄抑制过亢的代谢）。太阴病-胃肠道疾病，下痢霍乱皆其类（理中汤）；少阴病-心衰（四逆汤）肾衰（真武汤）之类；厥阴病-肝脾免疫终端之病，最终的免疫抗争成功疾病向愈，失败则引起脏厥或引发炎症风暴（乌梅丸、真人养脏汤）。
温病四分的四个层次：卫分证-呼吸道感染引发身体应急反应，合并部分局部淋巴组织感染（银翘散、桑菊饮）；气分证-病毒突破黏膜或淋巴系统进入血液，引发较剧烈的免疫反应（白虎汤、凉膈散）；营分证-反复发烧影响心血管系统，引发惊厥或心肌炎或出血（清营汤、安宫牛黄丸）；血分证-病毒进一步感染多器官，生理机能失常导致病理产物瘀滞，此时易引发炎症风暴，故凉血散血（犀角地黄汤、桃仁承气汤）。