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回复@青侨阳光-林伟: PROTAC 不止通过结合面来实现靶向,还要通过和 linker 形成的独特的三维位置来靶向,因此至少有两个机理来实现其特异性。
另外,由于人体中有多达 600 种的E3连接酶,这也保证了可以有多种选择进行尝试来增加成药的可能。
总的来说,虽然 PROTAC 筛选成药肯定不容易,但反过来,相对小分子抑制剂需要较深的口袋这个巨大的障碍来说,PROTAC 的成药并没有原则性的障碍。
至于目前还没有 undrugable 靶点上的颠覆性数据突破的原因也很简单,大部分的 PROTAC 药企毕竟是初创公司,肯定还是要先求稳的,用现成的靶点做出一两个生存下来再去挑战没做过的靶点。
无论如何,我认为 PROTAC 这个肯定是个正确的方向,毕竟人体细胞内所有的蛋白都基本是靠这个系统来降解的。//@青侨阳光-林伟:回复@金牛在肩:谢探讨~ 我们的不一定对,仅参考。
对于PROTAC,应该也没那么容易成药吧:
mRNA、siRNA、或者gene repacement和CRISPR,是二维序列层面的靶向,可能一个通了,其它照着复制就成了…… 但PROTAC毕竟还是靶向三维构象的,还是得去筛结构筛分子,靶蛋白结合域和E3连接酶两头都要筛。
细胞内2万基因和几十万蛋白,这里的构象太容易“撞脸”了,每个蛋白也不是随便找个结合面就能靶向的,不然太容易脱靶了,还是得筛每个蛋白“独特”的结构区吧,这个就算不局限在活性口袋,也不是随随便便就找到的。另外,linker和E3连接酶啥的,不同细胞和组织可能需求也不同,可能也得筛,加上PROTAC需要同时加入多个功能,分子量肯定小不了,同时符合特异性、亲和力、可溶性、生物利用度等,估计也不好弄。
不然为什么PROTAC火爆了这么久,看到明确前景的更多还是AR这样已经证明drugable target?既然PROTAC那么容易,为什么这么久了也没真正看到几个undrugable 靶点上的颠覆性数据突破?
个人理解,PROTAC还是受到三维构象的约束,每个靶点还都得经历复杂的筛选,这会带来理论与现实的差异,也不是随随便便都找得到理想降解剂的。
引用:
2021-10-09 16:41
本文为 $青侨阳光(P000385)$ 9月报行业思考部分节选~
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2021-10-11 09:25

问了一下protac研发的人,“其实随着做的人越来越多,研究也越来越深入,我现在对于它不需要非常牢固的结合就能起作用也有点持怀疑态度,而且还有文章报道其实双功能分子两头的亲和力都很重要,如果两头的亲和力差距太大,那基本上是很难形成三元复合物的“

2021-10-10 22:48

认同PROTAC降解潜力和方向的,就是觉得仍然受三维构象约束,还得一个个去“摸”去“试”,找到特别理想的分子可能不是太容易。